Графические чипы расшифруют геном человека за 60 секунд?


Genom_human

Ученые из Академгородка в Новосибирске научились расшифровывать геном человека за 20 минут. Планируется, что совершенствованием этой технологии займется малое инновационное предприятие "ГЕОсофтЛАБ". Предприятие создано Новосибирским государственным университетом совместно с Институтом нефтегазовой геологии и геофизики СО РАН и компанией "СофтЛаб-НСК", сообщает Середина общественных связей СО РАН.


Учредители уже наметили строй задач, которые будет находить решение новое предприятие. Как известно, геофизика - крупнейший, если не самый-самый изрядный, потребитель компьютерных ресурсов", - говорит декан факультета информационных технологий НГУ врач физико-математических наук профессор Михаил Лаврентьев. Розыск полезных ископаемых и их извлечение - это сильно здоровенный и нелегкий счет, огромные задачи.



Genom_human

В Новосибирске есть предприятие, которое выпускает зонды для нефтяных скважин, спроектированные в ИНГГ СО РАН. Для обработки полученных данных в институте создано соответствующее программное обеспечение. Но институту не свойственно заниматься продажами, и мы надеемся, что это станет одним из направлений работы созданного предприятия. СофтЛаб-НСК" займется совершенствованием этого продукта, а вуз планирует организацию курсов по владению этим пакетом, требующим профессионального уровня умений.


Позитивный навык в этом направлении позволительно будет распространять и на другие программные решения, пишет портал Сибкрай.ру. В конечном итоге мы планируем создать линейку программных продуктов, которые будут обслуживать уникальные приборы, созданные и создаваемые в нашем институте и производимые научно-производственным предприятием геофизической аппаратуры "Луч".



Genom_human

Как всем понятно, "железо" ничего не стоит без современной интеллектуальной начинки, созданной с использованием информационных технологий", - добавляет заместитель директора по научной работе ИНГГ СО РАН лекарь технических наук Игорь Ельцов. Есть совместные наработки с Институтом цитологии и генетики СО РАН по биоинформатике. В частности, геном одного человека занимает 3,6 Гб памяти, в текущий момент геномов расшифровано очень немало, эту информацию нужно обрабатывать, это невероятно большие расчеты.



Genom_human

Проблема "Поиск мотива в геномной последовательности" считается на персональном компьютере 14 дней, на кластере - сутки, на ПК с использованием возможностей современного графического ускорителя - 9 часов, на ПК со специальным графическим ускорителем - 6,5 часов. Если определить более дорогой кристалл FPGA, больший по размеру, то, по теоретическим прикидкам, процесс сократится до 1 минуты.


Выигрыш в производительности в сравнении с начальными результатами - 20 тысяч раз, что позволяет приниматься за новые классы задач.


Судя по их названию, этому тексту релевантны статьи:

  1. 9 часов без подзарядки? Положитесь на Samsung NP-X120-FA02 - X серия

    9 часов без подзарядки? Положитесь на Samsung NP-X120-FA02 - X серия Это самый мощный ноутбук на базе двухъядерного процессора Intel последнего поколения позволяет работать до 9 часов без подзарядки, поэтому легко быть на связи где угодно и когда угодно.

  2. LG коммуникатор 210 серии под управлением Windows Mobile 6.5

    LG коммуникатор 210 серии под управлением Windows Mobile 6.5 LG представила коммуникатор под управлением Windows Mobile 6.5 для корейского рынка, известный под названиями LG-SU210, KU2100 и LU2100. Работающий на новом пользовательском интерфейсе под названием 'beehive UI', новый LG 210 серии оснащён 3-дюймовым сенсорным дисплеем с разрешением 240x480 пикселей, 5 Mп камерой с автофокусом, T-DMB тюнером, слотом для карт памяти microSD, модулями Bluetooth, Wi-Fi, GPS, аккумулятором ёмкостью 1500 мАч и работает в сетях WCDMA (HSPA) и GSM.

  3. Volitan - самый экологичный катер

    Volitan - самый экологичный катер Летающая рыба" Volitan использует энергию ветра и солнца, а управляет всем этим особый бортовой компьютер. Инновация данного концепта содержится в том, что катер оснащен "твердыми" парусами.

  4. Создано безопасное устройство для беспроводной зарядки электромобилей

    Сделанное под управлением доктора Уайтхеда устройство употребляет безопасные токи низкой частоты. Его удачные тесты прошли в кампусе на пары электромобилях смотрите видео. Бесконтактная зарядка автономных источников питания употребляется там, где подключать разъем неудобно либо нереально.

Хомячковый рай. Уйти и потеряться:

Комментарии к этой заметке больше не принимаются.


Скорость сайта обеспечена Телесистемами

Новости за неделю:

Самые Главные

Анонсы статей по темам:

Сервисы

Наши услуги:



На верх страницы .
Расход памяти: 6,5 Mb | Created in 0,23669 seconds Rambler's Top100 EXTREME TECHNOLOGY ©ZX 2008